- a -

• align() : BioUtilities.h
• alignLines() : BioUtilities.h
• angle() : BioUtilities.h
• angleBetweenDirectionCosines() : BioUtilities.h

- b -

• BioAngle() : BioAtom.h , BioPoint.h
• BioClear() : BioUtilities.h
• BioDeterminant3by3() : BioUtilities.h
• BioDifferenceVector() : BioAtom.h
• BioDirectionCosines() : BioAtom.h , BioPoint.h
• BioDistance() : BioAtom.h , BioPoint.h
• BioDotMagnitude() : BioAtom.h
• BioDotProduct() : BioAtom.h
• BioGetChar() : BioUtilities.h
• BioGetDnaSequences() : BioDnaSequence.h
• BioGetRandomDnaSequence() : BioDnaSequence.h
• BioGetRandomProteinSequence() : BioProteinSequence.h
• BioInverse3by3() : BioUtilities.h
• BioNormalize() : BioAtom.h
• BioShowAcidicAminoAcids() : BioUtilities.h
• BioShowAmbiguousRestrictionEnzymes() : BioUtilities.h
• BioShowAminoAcidAmbiguityCode() : BioUtilities.h
• BioShowAminoAcidProperties() : BioUtilities.h
• BioShowBasicAminoAcids() : BioUtilities.h
• BioShowDnaSubstitutionMatrix() : BioUtilities.h
• BioShowFTKs() : BioUtilities.h
• BioShowFTQs() : BioUtilities.h
• BioShowInBrowser() : BioUtilities.h
• BioShowNonPolarAminoAcids() : BioUtilities.h
• BioShowNucleicAcidAmbiguityCode() : BioUtilities.h
• BioShowNucleicAcidProperties() : BioUtilities.h
• BioShowPolarAminoAcids() : BioUtilities.h
• BioShowProteinSubstitutionMatrix() : BioUtilities.h
• BioShowSpaceGroupNames() : BioUtilities.h
• BioShowStandardCodonTable() : BioUtilities.h
• BioShowUnAmbiguousRestrictionEnzymes() : BioUtilities.h
• BioShowUniqueAmbiguousRestrictionEnzymes() : BioUtilities.h
• BioShowUniqueUnAmbiguousRestrictionEnzymes() : BioUtilities.h
• BioTorsion() : BioAtom.h , BioPoint.h
• BioVectorCrossProduct() : BioAtom.h , BioPoint.h , BioAtom.h
• breakLines() : BioUtilities.h

- c -

• checkFloat() : BioUtilities.h
• crlf() : BioSocketStream.h

- d -

• delimiter() : BioUtilities.h
• determinant() : BioUtilities.h
• distance() : BioUtilities.h

- e -

• extractDataBlock() : BioUtilities.h

- g -

• getUniqueVectorElements() : BioUtilities.h

- h -

• helix() : BioAtom.h
• helixAxisDirectionCosines() : BioAtom.h

- l -

• leftTrim() : BioUtilities.h
• lfcr() : BioSocketStream.h

- o -

• operator<<() : BioSocketAddress.h
• operator>>() : BioSocketAddress.h

- p -

• parseStr() : BioUtilities.h
• printVector() : BioUtilities.h
• processString() : BioUtilities.h

- r -

• removeVectorElements() : BioUtilities.h
• replaceString() : BioUtilities.h
• reverseLargeString() : BioUtilities.h
• reverseString() : BioUtilities.h
• rightTrim() : BioUtilities.h
• rmBlank() : BioUtilities.h
• roundNumber() : BioUtilities.h

- s -

• splitString() : BioUtilities.h
• stringToDouble() : BioUtilities.h
• stringToFloat() : BioUtilities.h
• stringToInt() : BioUtilities.h
• stringToLong() : BioUtilities.h

- t -

• toDegrees() : BioUtilities.h
• toLowerCase() : BioUtilities.h
• toRadians() : BioUtilities.h
• torsion() : BioUtilities.h
• toString() : BioUtilities.h
• toUpperCase() : BioUtilities.h