BioInt  1.02.00
BioInt: An integrative biological object-oriented application framework and interpreter
BioEst.h
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00001 #ifndef BIOEST_H
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00003 #include <string>
00004 #include <vector>
00005 #include <iostream>
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00007 using namespace std;
00008 
00009 class BioEst
00010 {
00011          string type_,status_, contName_,citation_,library_,estNum_;
00012          string clone_,source_,sourceDna_,sourceInHost_, pcrF_,pcrB_,insert_;
00013          string seqPrimer_,pEnd_,dnaType_,public_,error_,putID_,plate_;
00014          string polyA_,comment_,sequence_;
00015          
00016          long row,column,hiqualStart,hiqualStop; 
00017           
00018     void setNULL();
00019         //long stringToLong(const string&);
00020 
00021         public:
00022            BioEst();
00023            BioEst(const string);
00024 
00025            void setEst(vector<string>&);
00026                    
00027                    string getType();
00028                    string getStatus();
00029                    string getContName();
00030                    string getCitation();
00031                    string getLibrary();
00032                    string getEstNumber();
00033                    string getClone();
00034                    string getSource();
00035                    string getSourceDna();
00036                    string getSourceInHost();
00037                    string getPcrF();
00038                    string getPcrB();
00039                    string getInsert();
00040                    string getPlate();
00041                    string getSeqPrimer();
00042                    string getPEnd();
00043                    string getDnaType();
00044                    string getPublic();
00045                    string getPolyA();
00046                    string getComment();
00047                    string getSequence();
00048                    string getError();
00049                    string getPutID();
00050 
00051                    long getRow();
00052                    long getColumn();
00053                    long getHiqualStart();
00054                    long getHiqualStop();
00055 
00056            void showEst(ostream & = cout);
00057 };
00058 #endif
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