BioMultipleSwissProt.h

Go to the documentation of this file.

#ifndef BIOMULTIPLESWISSPROT_H
#define BIOMULTIPLESWISSPROT_H

#include <string>
#include <vector>

using namespace std;
#include "BioSwissProt.h"

class BioMultipleSwissProt
{
        vector <BioSwissProt> multipleswissprot_;
   public :
        BioMultipleSwissProt();
        BioMultipleSwissProt(const string&);
        
        long getNumberOfEntries();
        BioSwissProt getEntry(long);


  friend BioMultipleSwissProt operator+= (BioMultipleSwissProt& , BioSwissProt );

  friend BioMultipleSwissProt operator+( BioMultipleSwissProt , BioSwissProt& );
  friend BioMultipleSwissProt operator+( BioSwissProt&, BioSwissProt&);

  void pushEntry(BioSwissProt&);
  BioMultipleSwissProt getEntriesByOrganism(const string& );
  BioMultipleSwissProt getEntriesByProtein(const string& );
  vector<string>  getUniqueOrganisms();
  
  void showInMultipleFasta(const string& );
  void showInMultipleFasta(ostream& = cout);
  void showInFasta(int, ostream& = cout);
                          
};
#endif